Anatoly Sorokin

Anatoly Sorokin

Still alive

Posts by Tags

AI

Bioconductor

The new Bioconductor release

2 minute read

Published:

The new version (1.4) of the BioNAR package is released. In this version we add the number of important features:

New package version in Bioconductor

less than 1 minute read

Published:

We’ve got the new version of the package BioNAR accepted for the Bioconductor release 3.17. The package is designed for step by step analysis biological networks with sophisticated metrics such as Perturbation Entropy or Disease-Disease separation. Package contains number of real networks as datasets: presynaptic PPI network and Barabasi’s bipartite Diseasome network Goh.t al. 2007.

New package in Bioconductor

less than 1 minute read

Published:

We’ve got the new package BioNAR accepted for the Bioconductor release 3.16. The package is designed for step by step analysis biological networks with sophisticated metrics such as Perturbation Entropy or Disease-Disease separation. Package contains number of real networks as datasets: presynaptic PPI network and Barabasi’s bipartite Diseasome network Goh.t al. 2007.

CRAN

FBA

Так вот ты какой, гомеостаз!

6 minute read

Published:

В процессе подготовки данных для анализа чувствительности пришлось насчитать более полумиллиона потоковых моделей метаболической сети E. coli. Каждая такая модель имела одинаковую структуру сети, но различные ограничения на скорости более 1100 обменных потоков, моделируя различные составы среды. Таким образом мы можем сравнить поведение метаболической системы бактерии в различных условиях доступности как существенных метаболитов, таких как источники углерода и азота, так и токсинов и лекарств.

R

The new Bioconductor release

2 minute read

Published:

The new version (1.4) of the BioNAR package is released. In this version we add the number of important features:

New package version in Bioconductor

less than 1 minute read

Published:

We’ve got the new version of the package BioNAR accepted for the Bioconductor release 3.17. The package is designed for step by step analysis biological networks with sophisticated metrics such as Perturbation Entropy or Disease-Disease separation. Package contains number of real networks as datasets: presynaptic PPI network and Barabasi’s bipartite Diseasome network Goh.t al. 2007.

New package in Bioconductor

less than 1 minute read

Published:

We’ve got the new package BioNAR accepted for the Bioconductor release 3.16. The package is designed for step by step analysis biological networks with sophisticated metrics such as Perturbation Entropy or Disease-Disease separation. Package contains number of real networks as datasets: presynaptic PPI network and Barabasi’s bipartite Diseasome network Goh.t al. 2007.

biological networks

Так вот ты какой, гомеостаз!

6 minute read

Published:

В процессе подготовки данных для анализа чувствительности пришлось насчитать более полумиллиона потоковых моделей метаболической сети E. coli. Каждая такая модель имела одинаковую структуру сети, но различные ограничения на скорости более 1100 обменных потоков, моделируя различные составы среды. Таким образом мы можем сравнить поведение метаболической системы бактерии в различных условиях доступности как существенных метаболитов, таких как источники углерода и азота, так и токсинов и лекарств.

The new Bioconductor release

2 minute read

Published:

The new version (1.4) of the BioNAR package is released. In this version we add the number of important features:

New package version in Bioconductor

less than 1 minute read

Published:

We’ve got the new version of the package BioNAR accepted for the Bioconductor release 3.17. The package is designed for step by step analysis biological networks with sophisticated metrics such as Perturbation Entropy or Disease-Disease separation. Package contains number of real networks as datasets: presynaptic PPI network and Barabasi’s bipartite Diseasome network Goh.t al. 2007.

New package in Bioconductor

less than 1 minute read

Published:

We’ve got the new package BioNAR accepted for the Bioconductor release 3.16. The package is designed for step by step analysis biological networks with sophisticated metrics such as Perturbation Entropy or Disease-Disease separation. Package contains number of real networks as datasets: presynaptic PPI network and Barabasi’s bipartite Diseasome network Goh.t al. 2007.

deep neural nets

Инженерные модели, и с чем их едят

5 minute read

Published:

Модель есть представление некоего объекта или явления в какой-либо форме (например, в математической, физической, символической, графической или дескриптивной), предназначенное для рассмотрения определённых аспектов изучаемого объекта или явления и позволяющее получить ответы на изучаемые вопросы.

diagram

engineering models

Инженерные модели, и с чем их едят

5 minute read

Published:

Модель есть представление некоего объекта или явления в какой-либо форме (например, в математической, физической, символической, графической или дескриптивной), предназначенное для рассмотрения определённых аспектов изучаемого объекта или явления и позволяющее получить ответы на изучаемые вопросы.

flux

Так вот ты какой, гомеостаз!

6 minute read

Published:

В процессе подготовки данных для анализа чувствительности пришлось насчитать более полумиллиона потоковых моделей метаболической сети E. coli. Каждая такая модель имела одинаковую структуру сети, но различные ограничения на скорости более 1100 обменных потоков, моделируя различные составы среды. Таким образом мы можем сравнить поведение метаболической системы бактерии в различных условиях доступности как существенных метаболитов, таких как источники углерода и азота, так и токсинов и лекарств.

modeling

Инженерные модели, и с чем их едят

5 minute read

Published:

Модель есть представление некоего объекта или явления в какой-либо форме (например, в математической, физической, символической, графической или дескриптивной), предназначенное для рассмотрения определённых аспектов изучаемого объекта или явления и позволяющее получить ответы на изучаемые вопросы.

package development

The new Bioconductor release

2 minute read

Published:

The new version (1.4) of the BioNAR package is released. In this version we add the number of important features:

New package version in Bioconductor

less than 1 minute read

Published:

We’ve got the new version of the package BioNAR accepted for the Bioconductor release 3.17. The package is designed for step by step analysis biological networks with sophisticated metrics such as Perturbation Entropy or Disease-Disease separation. Package contains number of real networks as datasets: presynaptic PPI network and Barabasi’s bipartite Diseasome network Goh.t al. 2007.

New package in Bioconductor

less than 1 minute read

Published:

We’ve got the new package BioNAR accepted for the Bioconductor release 3.16. The package is designed for step by step analysis biological networks with sophisticated metrics such as Perturbation Entropy or Disease-Disease separation. Package contains number of real networks as datasets: presynaptic PPI network and Barabasi’s bipartite Diseasome network Goh.t al. 2007.

papers

release

The new Bioconductor release

2 minute read

Published:

The new version (1.4) of the BioNAR package is released. In this version we add the number of important features:

sampling

Так вот ты какой, гомеостаз!

6 minute read

Published:

В процессе подготовки данных для анализа чувствительности пришлось насчитать более полумиллиона потоковых моделей метаболической сети E. coli. Каждая такая модель имела одинаковую структуру сети, но различные ограничения на скорости более 1100 обменных потоков, моделируя различные составы среды. Таким образом мы можем сравнить поведение метаболической системы бактерии в различных условиях доступности как существенных метаболитов, таких как источники углерода и азота, так и токсинов и лекарств.