Published:
Модель есть представление некоего объекта или явления в какой-либо форме (например, в математической, физической, символической, графической или дескриптивной), предназначенное для рассмотрения определённых аспектов изучаемого объекта или явления и позволяющее получить ответы на изучаемые вопросы.
Published:
В процессе подготовки данных для анализа чувствительности пришлось насчитать более полумиллиона потоковых моделей метаболической сети E. coli. Каждая такая модель имела одинаковую структуру сети, но различные ограничения на скорости более 1100 обменных потоков, моделируя различные составы среды. Таким образом мы можем сравнить поведение метаболической системы бактерии в различных условиях доступности как существенных метаболитов, таких как источники углерода и азота, так и токсинов и лекарств.
Published:
Recent progress on development of generative AI systems cause a discussion of the area of their applicability. Recent paper
Published:
Another paper describing the BioNAR package is published in the CURRENT PROTOCOLS.
Published:
The new version (1.4) of the BioNAR package is released. In this version we add the number of important features:
Published:
The paper describing the BioNAR package is published in Bioinformatic Advances.
Published:
We’ve got the new version of the package BioNAR accepted for the Bioconductor release 3.17. The package is designed for step by step analysis biological networks with sophisticated metrics such as Perturbation Entropy or Disease-Disease separation. Package contains number of real networks as datasets: presynaptic PPI network and Barabasi’s bipartite Diseasome network Goh.t al. 2007.
Published:
We’ve got the new package BioNAR accepted for the Bioconductor release 3.16. The package is designed for step by step analysis biological networks with sophisticated metrics such as Perturbation Entropy or Disease-Disease separation. Package contains number of real networks as datasets: presynaptic PPI network and Barabasi’s bipartite Diseasome network Goh.t al. 2007.
Published:
We’ve got the rSpectral package published on CRAN. The package provides new implementation of the network clustering algorithm described in Newman (2006).